たとえば、’hoge’がフィールドを隠していますとか、Parameter hoge sohuld be finalなどといった警告が出ます。
この場合は，基本的には警告を有効にしたまま，対象となるゲッターセッター部分だけを無効にしたいものです。
このように、ソースの一部だけcheckstyleの警告を無視させるためには，以下のように、
Filters->Suppresson Comment Filterを有効に設定(Addする)して，
無効にしたいソースコードのスタート部分に
// CHECKSTYLE:OFF
チェックを再度有効にしたいところに
// CHECKSTYLE:ON
と言うコメントを入れるといいです。